Споры между предприятиями, организациями и учреждениями одного министерства, ведомства, кооперативной системы разрешаются в соответствующих арбитражах министерств и ведомств, которые называются ведомственными. Положение об арбитраже утверждается министерством, руководителем ведомства.
С целью единообразного решения общих вопросов организации и деятельности арбитражей Госарбитражем СССР и Министерством юстиции СССР 16 апреля 1976 г. одобрено Примерное положение об арбитражах министерств и ведомств СССР. Постановлением Совета Министров СССР от 7 августа 1970 г. № 646 "О повышении роли органов государственного арбитража и арбитражей министерств и ведомств в народном хозяйстве" на ведомственные арбитражи возложены те же задачи, что и на государственные.
Главными задачами этих арбитражей являются обеспечение защиты и имущественных прав и законных интересов предприятий, организаций и учреждений при разрешении хозяйственных споров, содействие повышению эффективности общественного производства, повышению роли договора, укрепление социалистической законности в хозяйственных отношениях и государственной дисциплины при выполнении плановых и договорных обязательств.
Ведомственные арбитражи разрешают подведомственные им споры, возникающие при заключении и исполнении договоров, а также по другим основаниям.
Разграничение подведомственности споров между арбитражами союзно-республиканских министерств и ведомств СССР и одноименных министерств и ведомств союзных республик производится в положении о соответствующем арбитраже.